马来西亚政府十分重视公共卫生保健的扩张和发展，投入了1％的政府预算用於这个社会部门的发展。过去一年，马来西亚卫生部已加紧努力全面改革制度，吸引更多的外国投资。政府也试图将这个国家提升为区域和国际的卫生保健中心。“政府推行一个全民卫生保健系统，这套系统与私营医疗系统并存。新生儿死亡率---这是卫生保健的整体效率的指标---2005年为千分之10，非常接近美国和西欧的水准。在2008年，出生时的预期寿命为74岁。”该国的卫生保健体系强制最近由医学院毕业的医生必须在公立医院服务三年，以确保这些医院维持基本的人力。与卫生保健部门有关的一个主要问题，是农村地区欠缺医疗中心，政府试图藉由发展并扩充一套远距初级保健体系，来解决这个问题。另一个问题是医师过度开立处方药物，虽然这在最近几年有所下降。
马来西亚的医疗系统是沿袭50年前英殖民国时建立的系统，所以医疗水平和医疗设施都很完备。国民的医疗福利也很高。在马来西亚，马来西亚的国民每次看病就只花1元钱。但是现在随着马来西亚的生活水平提高后，有钱人也越来越多，特别是华人。很多人已经不愿意去那种病人特别多且医生很繁忙的医院去看病，而这些国家医院也因为经费问题使得医疗设备无法得到及时更新。因此，近几年，高端水平的私立医院快速发展了起来。私立医院无论是医疗水平还是医疗设备以及服务态度等方面都较国立医院要好，价格方面也是比国立医院略高，略微有点经济基础的人都可以出得起钱看病。而且国家为了从整体方面带动医疗保障的发展水平，允许国民通过购买保险的手段获取这部分高水平的医疗待遇。现在第二家园的申请者也属于这部分人士，通过购买了医疗保险享受高水平的医疗待遇。国家也适当给予这部分的医疗费补贴。
马来西亚实行的是半公费医疗制度。病人如果是小病并在政府医院或诊所就诊，那么只收取基本的挂号费；如果是大病或需要住院，则要视病人是否为马来西亚的公务员和病人家庭经济状况而收取一定的费用。无论病人是否为公务员，只要在马来西亚的私人诊所看病，都需要自行负担医疗费用。但由于私人诊所的医疗质量和服务水平都普遍高于政府医院，因此到私人诊所看病的人员也相当多。
由于马来西亚仅实行半公费医疗的制度，因此大部分马来西亚人依然会因为生病而承担高额的医疗费用，特别是非公务人员的重症病人。针对这一情况，马来西亚政府的措施是仿照美国实行医疗保险计划。对此，马来西亚人是持认同态度的，他们也会主动购买各项医疗保险计划，来防止因发生疾病而给自己造成过重的经济负担。
