马耳他的医疗系统类似于英国，实行 全民免费公立医疗 制度。
居民每年缴纳200欧左右的医疗保险,即可在各大公立医院免费享受绝大多数医疗服务。
其医疗卫生系统在世卫排名中位列 全球第5位 ，排名较美国（37），澳大利亚（32），英国（18）和加拿大（30）更高。
【医疗体系】
马耳他有提供公费医疗的悠久历史。如今，马耳他既有由政府提供医疗保健服务的公立医疗系统，也有由私人投资设立的私立医疗保健系统。马耳他拥有强大的全科家庭医生队伍为国民提供初级医疗保健服务，而公立医院则主要对由家庭医生转介的病人提供二级和三级的医疗护理。此外，马耳他还拥有众多的医疗卫生志愿组织，如阿尔法医学会（高级护理），紧急消防及救援单位（EFRU），圣约翰救伤队及红十字会等,为马耳他居民提供急救及护理服务。
【 医疗卫生设施】
马耳他现代化的高级病房中每个病床都配有电脑电视及电话，病人在此期间可以看电视，上网，玩游戏，听音乐，一点都不会忧郁沉闷。除此之外马耳他医院的各个科室均是以建筑颜色来区分的，比如说棕色的代表是心血管相关科室，如果病人骨折了，那应该去相应的黄色建筑区寻找外科科室。这样一来对于病人十分省时方便。
有时候医院拿药的队伍可能有点长，这时候病人可以申请医院将其药物配送至距离病人较近的诊所即可，这样病人可以随时过去取药。
【著名医院】
马特（Mater Dei）医院，马耳他最大的公立医院，于2007年开业，为欧洲最大的医疗建筑之一
保罗博法医院，位于弗洛里亚纳的著名肿瘤医院
圣文森特德保罗医院，欧洲著名长者护理医院
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